A prisão de Macário Júdice Neto é preventiva, e ele permanece detido na superintendência da Polícia Federal, na Zona Portuária do Rio, além de estar afastado do cargo na Justiça Federal. Segundo a PF, o desembargador é investigado pelos crimes de organização criminosa armada, com participação de funcionário público, e obstrução de investigação.